Akoya Biosciences是Akoya Biosciences，Inc.（一家特拉華州公司）的注冊商標，而Spatial Biology Company是Akoya Biosciences，Inc.的商標。
表征組織微環(huán)境的復雜性是理解驅動疾病以及治療反應的分子和細胞機制的關鍵要素。
浸潤的免疫細胞和細胞基質重塑之間的空間關系作用被廣泛認為是定義組織異質性的關鍵成分。CODEX系統(tǒng)使研究人員能夠以單細胞分辨率對組織樣品中的40多種蛋白質標記物成像。高度復用的成像技術可以研究不同的細胞表型，以及它們如何在原位相互作用以影響疾病的病理和進展。
CODEX（通過indEXing進行共檢測）技術使用與專有Akoya條形碼偶聯(lián)的抗體，該條形碼由*的寡核苷酸序列組成。CODEX分析法使用染料標記的Reporter靶向特定條形碼，以進行高度特異性的檢測。
用CODEX抗體板對組織樣品進行單步染色，然后Reporters通過成像和去除的迭代循環(huán)與互補條形碼結合。循環(huán)由CODEX流體力學儀器*自動化。
靈活
為新鮮的冷凍或FFPE組織設計定制面板
樣品友好
可以對樣本重新成像以進行感興趣區(qū)域（ROI）分析
可擴展
以單細胞分辨率在單個組織樣本中成像40+個標記
全面
包括試劑和軟件分析套件
CODEX解決方案與許多組織類型和格式兼容。
人類乳腺FFPE組織被36重面板染色
肺癌FFPE組織被28重面板染色
人體皮膚新鮮的冷凍組織沾有26層面板
固定人PBMC并用26重面板染色
腎細胞癌FFPE組織用15重面板染色
弄臟
使用CODEX抗體面板準備和染色組織只需一步即可，從而減少了周轉時間并保持了樣品完整性。
圖片
全自動CODEX儀器和配套顯微鏡在您的組織中對40多個標記圖像進行成像。用戶可以將目標分辨率降至20倍的單細胞分辨率，將目標分辨率降至40倍的亞細胞分辨率。
分析
使用全面的CODEX軟件套件處理，分析和可視化圖像。用戶可以訪問可視化工具，如用于細胞表型的門控和聚類。用戶還可以導出文件以在第三方軟件中使用。
醫(yī)學博士安德拉斯·阿·赫茲（Andras A Heczey）
丹·L·鄧肯綜合癌癥中心兒科腫瘤學助理教授
貝勒醫(yī)學院
輸液后活檢非常珍貴……借助CODEX，我們的目標是從組織的小樣本中獲取多的數(shù)據，以盡可能多地了解腫瘤的微環(huán)境。
Garry Nolan博士
Rachford和Carlota A. Harris微生物學和免疫學系教授
斯坦福大學，Akoya Biosciences聯(lián)合創(chuàng)始人
CODEX的商業(yè)發(fā)布是我實驗室的一個里程碑，也是生物醫(yī)學科學的一個令人興奮的機會。同時經濟地分析完整組織上數(shù)十種或更多種蛋白質標記的能力將從根本上改變我們對細胞相互作用和疾病生物學的理解。
范德比爾特糖尿病中心的Powers＆Brissova研究小組使用CODEX來研究胰島微環(huán)境。
斯坦福大學的細胞科學成像設施（CSIF）通過CODEX系統(tǒng)上的多重成像項目擴展了其核心實驗室服務。
賓夕法尼亞大學的研究人員開發(fā)了一種方法，可以將單細胞CITE-seq數(shù)據映射到CODEX復用IHC圖像，以進行空間單細胞多組學研究。
CODEX分析法通過迭代成像循環(huán)靶向抗體組的子集，從而克服了傳統(tǒng)的多重免疫熒光技術的挑戰(zhàn)，從而在單個組織切片中揭示了40多種生物標志物。
我們提供了完整的解決方案，其中包括針對CODEX系統(tǒng)進行了優(yōu)化和驗證的抗體和試劑。經驗證和庫存的抗體可用于不同類型的組織：小鼠新鮮冷凍，人新鮮冷凍和人FFPE。用戶可以使用Akoya的定制偶聯(lián)試劑盒靈活地創(chuàng)建由市售的，經Akoya驗證的抗體或標有CODEX條形碼的克隆組成的面板。
試劑盒和試劑
用于組織染色，自定義綴合和執(zhí)行CODEX實驗的緩沖液和試劑
CODEX抗體
CODEX共軛抗體，用于構建抗體面板
CODEX條碼
修飾寡核苷酸，易于偶聯(lián)定制CODEX抗體
CODEX記者
熒光團偶聯(lián)的寡核苷酸，用于CODEX抗體的可視化
試劑盒和試劑
CODEX分析需要專門配制的試劑和緩沖液，以使用CODEX抗體對組織染色并進行迭代成像循環(huán)。對于每個成像周期，將三個帶有特定光譜染料的CODEX Reporter應用于染色的組織，以可視化相應的CODEX抗體。該CODEX儀器適用輕柔洗滌步驟去除CODEX記者無任何化學修飾，隨后施加下一組記者的想象下一組CODEX抗體。
目錄 ＃ | 名稱 | 尺寸 |
| 7000001 | 10X CODEX緩沖區(qū) | 10個反應 |
| 7000002 | CODEX檢測試劑 | 10個反應 |
| 7000003 | 核染色 | 10個反應 |
| 7000008 | CODEX染色套件 | 10個反應 |
| 7000009 | CODEX偶聯(lián)試劑盒 | 10個反應 |
| 7000010 | CODEX墊片v2 | 10個墊片 |
| 232107 | CODEX存儲緩沖區(qū) | 120毫升 |
| 7000005 | 蓋玻片 | 138 |
| 7000006 | 96孔板 | 10 |
| 7000007 | 96孔板密封 | 10 |
| 7000013 | CODEX蓋玻片儲物盒 | 1盒 |
CODEX抗體
CODEX抗體是單獨提供的，可以混合使用并與設計面板匹配，以同時分析多達40多種生物標志物。
Akoya提供經過充分測試的CODEX抗體和一系列補充抗體。
CODEX ®盤點抗體
CODEX清單抗體由Akoya提供，并已通過完整的CODEX抗體驗證過程和制造質量控制。我們庫存的抗體也得到了我們現(xiàn)場支持團隊的全面支持。
CODEX抗體已在多種類型的人類FFPE組織中進行了測試。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結合。每個試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應的染料標記的Reporter（RX000），在標準染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運行（或測試）。推薦用于FFPE組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™750。
目錄 ＃ | 名稱 | 尺寸 |
| 4450036 | b-Catenin1-BX020（12F7）-Atto 550-RX020 | 25項測試 |
| 4450030 | CD3e-BX045（EP449E）—Cy5-RX045 | 25項測試 |
| 4350018 | CD4-BX003（EPR6855）—Cy5-RX003 | 25項測試 |
| 4250012 | CD8-BX026（C8 / 144B）-Atto 550-RX026 | 25項測試 |
| 4350020 | CD11c-BX024（118 / A5）—Cy5-RX024 | 25項測試 |
| 4150018 | CD20-BX007（L26）— Alexa Fluor™488-RX007 | 25項測試 |
| 4450018 | CD20-BX007（L26）— Alexa Fluor™750-RX007 | 25項測試 |
| 4450027 | CD21-BX032（EP3093）—阿托550-RX032 | 25項測試 |
| 4150017 | CD31-BX001（EP3095）— Alexa Fluor™488-RX001 | 25項測試 |
| 4450017 | CD31-BX001（EP3095）— Alexa Fluor™750-RX001 | 25項測試 |
| 4250002 | CD44-BX005（IM7）-阿托550-RX005 | 25項測試 |
| 4250023 | CD45RO-BX017（UCHL1）-Atto 550-RX017 | 25項測試 |
| 4350019 | CD68-BX015（KP1）—Cy5-RX015 | 25項測試 |
| 4350001 | CD107a-BX006（H4A3）—Cy5-RX006 | 25項測試 |
| 4250021 | E-cadherin-BX014（4A2C7）-Atto 550-RX014 | 25項測試 |
| 4350021 | 組蛋白H3磷酸酯（Ser28）-BX030（HTA28）-Cy5-RX030 | 25項測試 |
| 4450029 | HLA-DR-BX033（EPR3692）—Cy5-RX033 | 25項測試 |
| 4450031 | 角蛋白14-BX002（聚19053）—阿托550-RX002 | 25項測試 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25項測試 |
| 4450032 | LIF-BX006（M1506B09）—Cy5-RX006 | 25項測試 |
| 4450034 | Mac2 / Galectin-3-BX035（M3 / 38）-Atto 550-RX035 | 25項測試 |
| 4150020 | 泛細胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™488-RX019 | 25項測試 |
| 4450020 | 泛細胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™750-RX019 | 25項測試 |
| 4250004 | Podoplanin-BX023（NC-08）-Atto 550-RX023 | 25項測試 |
| 4450033 | TFAM-BX029（18G102B2E11）-Atto 550-RX029 | 25項測試 |
已經使用扁桃體組織測試了用于人類新鮮冷凍組織的CODEX抗體。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結合。每個試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應的染料標記的Reporter（RX000），在標準染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運行（或測試）。推薦用于人類新鮮冷凍組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。
目錄＃ | 名稱 | 尺寸 |
| 4250005 | CD2-BX002（RPA-2.10）-Atto 550-RX002 | 25項測試 |
| 4350008 | CD3-BX015（UCHT1）—Cy5-RX015 | 25項測試 |
| 4350010 | CD4-BX021（SK3）—Cy5-RX021 | 25項測試 |
| 4150004 | CD8-BX004（SK1）—Alexa Fluor™488-RX004 | 25項測試 |
| 4450004 | CD8-BX004（SK1）— Alexa Fluor™750-RX004 | 25項測試 |
| 4350012 | CD11c-BX027（S-HCL-3）—Cy5-RX027 | 25項測試 |
| 4350003 | CD19-BX003（HIB19）—Cy5-RX003 | 25項測試 |
| 4150009 | CD21-BX013（Bu32）-Alexa Fluor™488-RX013 | 25項測試 |
| 4450009 | CD21-BX013（Bu32）-Alexa Fluor™750-RX013 | 25項測試 |
| 4250009 | CD31-BX032（WM59）—阿托550-RX032 | 25項測試 |
| 4250020 | CD34-BX035（561）-阿托550-RX035 | 25項測試 |
| 4150007 | CD38-BX007（HB-7）-Alexa Fluor™488-RX007 | 25項測試 |
| 4450007 | CD38-BX007（HB-7）-Alexa Fluor™750-RX007 | 25項測試 |
| 4150003 | CD45-BX001（HI30）— Alexa Fluor™488-RX001 | 25項測試 |
| 4450003 | CD45-BX001（HI30）— Alexa Fluor™750-RX001 | 25項測試 |
| 4250023 | CD45RO-BX017（UCHL1）-Atto 550-RX017 | 25項測試 |
| 4350007 | CD49f-BX033（GoH3）—Cy5-RX033 | 25項測試 |
| 4250022 | CD69-BX041（FN50）-阿托550-RX041 | 25項測試 |
| 4150021 | CD90-BX022（5E10）－Alexa Fluor™488-RX022 | 25項測試 |
| 4450021 | CD90-BX022（5E10）－Alexa Fluor™750-RX022 | 25項測試 |
| 4250008 | CD104-BX005（58XB4）-Atto 550-RX005 | 25項測試 |
| 4150008 | CD138-BX010（MI15）-Alexa Fluor™488-RX010 | 25項測試 |
| 4450008 | CD138-BX010（MI15）— Alexa Fluor™750-RX010 | 25項測試 |
| 4250013 | CD278-BX017（C398.4A）-Atto 550-RX017 | 25項測試 |
| 4250010 | CD279-BX014（EH12.2H7）-Atto 550-RX014 | 25項測試 |
| 4250006 | HLA-DR-BX026（L243）—阿托550-RX026 | 25項測試 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25項測試 |
| 4150020 | 泛細胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™488-RX019 | 25項測試 |
| 4450020 | 泛細胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™750-RX019 | 25項測試 |
| 4250004 | Podoplanin-BX023（NC-08）-Atto 550-RX023 | 25項測試 |
已使用脾臟組織測試了用于小鼠新鮮冷凍組織的CODEX抗體。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結合。每個試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應的染料標記的Reporter（RX000），在標準染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運行（或測試）。推薦用于小鼠新鮮冷凍組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。
目錄＃ | 名稱 | 尺寸 |
| 4350014 | CD3-BX021（17A2）—Cy5-RX021 | 25項測試 |
| 4250016 | CD4-BX026（RM4-5）—阿托550-RX026 | 25項測試 |
| 4250007 | CD5-BX017（53-7.3）-Atto 550-RX017 | 25項測試 |
| 4250017 | CD8a-BX029（53-6.7）-Atto 550-RX029 | 25項測試 |
| 4150015 | CD11b-BX025（M1 / 70）—Alexa Fluor™488-RX025 | 25項測試 |
| 4450015 | CD11b-BX025（M1 / 70）-Alexa Fluor™750-RX025 | 25項測試 |
| 4350013 | CD11c-BX030（N418）—Cy5-RX030 | 25項測試 |
| 4250014 | CD19-BX020（6D5）-Atto 550-RX020 | 25項測試 |
| 4250015 | CD21 / 35-BX023（7E9）-Atto 550-RX023 | 25項測試 |
| 4150014 | CD24-BX022（M1 / 69）—Alexa Fluor™488-RX022 | 25項測試 |
| 4450014 | CD24-BX022（M1 / 69）－Alexa Fluor™750-RX022 | 25項測試 |
| 4250001 | CD31-BX002（MEC13.3）-Atto 550-RX002 | 25項測試 |
| 4150013 | CD38-BX019（90）— Alexa Fluor™488-RX019 | 25項測試 |
| 4450013 | CD38-BX019（90）－Alexa Fluor™750-RX019 | 25項測試 |
| 4250002 | CD44-BX005（IM7）-阿托550-RX005 | 25項測試 |
| 4150002 | CD45-BX007（30-F11）— Alexa Fluor™488-RX007 | 25項測試 |
| 4450002 | CD45-BX007（30-F11）— Alexa Fluor™750-RX007 | 25項測試 |
| 4150006 | CD45R / B220-BX010（Ra3-6B2）-Alexa Fluor™488-RX010 | 25項測試 |
| 4450006 | CD45R / B220-BX010（Ra3-6B2）-Alexa Fluor™750-RX010 | 25項測試 |
| 4350007 | CD49f-BX033（GoH3）—Cy5-RX033 | 25項測試 |
| 4350016 | CD71-BX027（RI7217）—Cy5-RX027 | 25項測試 |
| 4450001 | CD90.2-BX001（30-H12）－Alexa Fluor™750-RX001 | 25項測試 |
| 4150001 | CD90.2-BX001（30-H12）－Alexa Fluor™488-RX001 | 25項測試 |
| 4350005 | CD169-BX015（3D6.112）—Cy5-RX015 | 25項測試 |
| 4150012 | IgD-BX016（11-26c.2a）-Alexa Fluor™488-RX016 | 25項測試 |
| 4450012 | IgD-BX016（11-26c.2a）-Alexa Fluor™750-RX016 | 25項測試 |
| 4150011 | IgM-BX013（RMM-1）-Alexa Fluor™488-RX013 | 25項測試 |
| 4450011 | IgM-BX013（RMM-1）-Alexa Fluor™750-RX013 | 25項測試 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25項測試 |
| 4350015 | Ly6g-BX024（1A8）—Cy5-RX024 | 25項測試 |
| 4250003 | MHC II-BX014（M5 / 114.15.2）-Atto 550-RX014 | 25項測試 |
| 4350006 | TCRb-BX003（H57-597）—Cy5-RX003 | 25項測試 |
| 4150005 | Ter119-BX004（TER-119）-Alexa Fluor™488-RX004 | 25項測試 |
| 4450005 | Ter119-BX004（TER-119）-Alexa Fluor™750-RX004 | 25項測試 |
CODEX ®屏蔽抗體
Akoya并未列出或提供CODEX篩選的抗體，但包括一系列已純化并成功與CODEX Barcodes結合并在次級淋巴組織中顯示陽性染色信號的克隆。這些克隆可從其他抗體供應商處商購獲得，但需要終用戶偶聯(lián)。CODEX條形碼和相關的共軛協(xié)議可通過Akoya獲得。
CODEX ®社區(qū)抗體
CODEX用戶群在不斷增長，我們鼓勵跨客戶站點的協(xié)作，以共享他們經過CODEX測試的克隆和協(xié)議的列表。這些CODEX社區(qū)抗體雖然證明與CODEX儀器兼容，但不會通過Akoya出售。終用戶需要共軛。CODEX條形碼和相關的共軛協(xié)議可通過Akoya獲得。我們正在繼續(xù)擴大名單。
CODEX ®抗體的自定義面板設計
Akoya的CODEX系統(tǒng)為用戶提供了靈活性，可以使用自定義偶聯(lián)試劑盒創(chuàng)建由Akoya驗證的抗體或標有CODEX Barcodes的克隆組成的面板。用戶可以使用CODEX偶聯(lián)試劑盒和各個CODEX條形碼從第三方抗體供應商處穩(wěn)健地制備克隆。
CODEX條碼
CODEX條形碼與CODEX偶聯(lián)試劑盒一起使用，可用于定制抗體面板設計。每個試劑盒均包含一管凍干條形碼，用于單個結合反應；兩管Reporters，用于優(yōu)化CODEX抗體滴定和CODEX運行。對于每個條形碼，都有足夠的體積用于50 µg抗體偶聯(lián)，根據產量和滴度，可以提供足夠的材料用于10至50個染色。
